孤店子镇，隶属于吉林省吉林市昌邑区，地处昌邑区西北部，位于松花江西岸，东与经济开发区九站乡接壤，南与船营区相连，西与桦皮厂镇毗邻，西北与新胜相接，北与土城子乡交界，距吉林市区25千米，区域总面积71.4平方千米。

清嘉庆二十五年（1820年），孤店子镇境域设孤店子屯；1984年，设立孤店子镇。截至2018年末，孤店子镇户籍人口为23426人。截至2020年6月，孤店子镇下辖1个社区、10个行政村，镇人民政府驻民航路9号。

2018年，孤店子镇有工业企业34个，其中规模以上2个，有营业面积超过50平方米以上的综合商店或超市15个。