种畜场隶属于黑龙江省黑河市孙吴县，属于县级直属国营单位。其位于小兴安岭北麓，北邻黑河市，南接五大连池市，地处孙吴县行政区域内。根据2025年官方行政区划数据，孙吴县下辖2个镇、9个乡、94个行政村及28个自然屯，并包含7个国营林场、1个国营苗圃、1个良种场和1个种畜场，该种畜场是孙吴县基层行政体系的重要组成部分。