福建三元经济开发区是位于福建省三明市三元区的一个省级经济开发区。该开发区于2002年12月经三明市人民政府批准设立，2006年5月经国家发改委审核，获福建省人民政府正式批复晋升为省级开发区并更名为“福建三元经济开发区”。

2003年4月8日，三元区工业园管理委员会正式组建，同年8月成立了三明市金园开发有限公司。开发区规划总面积49.5平方公里，初步形成了以机械制造、食品加工、氟硅新材料和生物医药为主导的产业雏形，对荆东工业园、黄砂新材料循环经济产业园等多个工业园进行统一管理。