南秦水库是一座以防洪为主，兼顾灌溉、发电、养殖综合利用的水利枢纽工程。位于陕西省商洛市商州区丹江一级支流南秦河上游，总库容900多万立方米。金陵寺河自西北向东南流入水库。水库为商洛市区第二水源地，是小(一)型水库。

20世纪90年代，南秦水库电站建成，装机容量500千瓦。2008年以来，水库实施了除险加固工程。2021年，西北设计院在商州区境内初选南秦水库作为抽水蓄能工程项目点，但未被采用。2023年，西起南秦水库、东至两河口的南秦河生态治理项目启动；242国道南秦水库路段建有观景台2处；高铁康养新城规划西接南秦水库。2024年，南秦水库管理站编撰防汛预案并成立防汛抢险指挥部，实行汛期24小时值班制度，全年向杨峪河镇5个村1.5万群众输送水量700万立方；同年发生水库坝体标语事件。2025年，商洛市人民政府批复南秦水库城乡一体化工程项目土地征收补偿方案；商洛市南秦水库城乡供水一体化工程获批，计划新建日处理规模30000立方米的水厂。2026年，商洛市自然资源局商州分局公告拟收回南秦水库管理站3.86亩国有土地使用权；商洛市南秦水库城乡供水一体化工程（高铁新城临时供水工程）环境影响报告表被受理。