新疆巩乃斯种羊场有限公司位于新疆维吾尔自治区伊犁哈萨克自治州新源县，主营业务为细毛羊育种、羊毛及畜产品销售、玉米制种等。其前身为1939年成立的巩乃斯种羊场，于2005年10月改制为公司。公司是国家级重点种畜场，2014年被定为畜禽养殖“国家级标准化示范场”。2020年，其办社会职能移交属地政府管理。